Gestão de coleções biológicas com Specify 6 e publicação de dados através do GBIF - MMF - 6 a 9 de Novembro de 2023

Formação Specify

Museu de História Natural do Funchal - 6 a 9 de Novembro de 2023

Co-organização entre o MMF e o GBIF Portugal.

Objetivo do curso
Data
Local
Descrição
Requisitos
Programa
Apresentações
Exercícios
Máquina Virtual
Lista de participantes

Participantes no curso

Participantes no curso de formação. Para descarregar a imagem na resolução original, clique aqui

Objetivo do curso

O principal objetivo do curso é proporcionar aos participantes as conhecimentos e prática necessária para o uso do sistema de gestão de coleções biológicas Specify 6, e preparar a publicação de dados através do GBIF.

Data

06-09 de Novembro de 2023.

Local

Câmara Municial do Funcha, Sala de Formação da Divisão de Sistemas de Informação, Edifício dos Paços do Concelho, Rua do Padre José Gonçalves da Câmara, r/c.

Descrição

O curso é dirigido a colaboradores, curadores ou técnicos envolvidos na catalogação, gestão e utilização de coleções biológicas e de história natural, que usem ou pretendam utilizar o sistema Specify, versão 6. Inclui um módulo sobre a publicação de dados de biodiversidade através do GBIF, incluindo a utilização da plataforma Integrated Publishing Toolkit (IPT). O Specify é um sistema desenvolvido pelo Biodiversity Informatics Group do Museu de História Natural da Universidade do Kansas, com 30 anos de existência e atualmente utilizado por mais de 500 coleções em 38 países. Em Portugal, o sistema é usado por 7 instituições para a gestão de 13 coleções de herbário, de aves, de mamíferos, entomológicas, crustáceos invertebrados marinhos e paleontológicas.

O curso tem uma estrutura teórico-prática que cobrirá os seguintes tópicos:

  • Catalogação de espécimes

  • Edição e pesquisa de registos

  • Controlo de qualidade e limpeza dos dados

  • Georreferenciação

  • Gestão de empréstimos, trocas e ofertas

  • Impressão de relatórios e etiquetas

  • Importação e exportação de dados, incluindo exportação para o GBIF

  • Publicação de dados através da plataforma GBIF Integrated Publishing Toolkit (IPT)

Requisitos

Não são necessários requisitos particulares para a participação no curso, para além de prática fluente de utilização de computadores e software na ótica do utilizador. A experiência anterior na preparação, manutenção, gestão e curadoria de coleções biológicas favorece um melhor aproveitamento do curso, mas estes não são requisitos.

Data: 6 a 9 de Novembro de 2023
Local: Câmara Municipal do Funcha, sala (para ser definida)
Organização: Museu de História Natural do Funchal (Câmara Municipal do Funchal) e Nó Português do GBIF (Instituto Superior de Agronomia)
Formador: Rui Figueira
Língua do curso: Português
Nº máximo de participantes: 20
Total de horas de formação: 24 h

Contacto: node@gbif.pt

Programa (provisório)

(descarregar programa em pdf)




Hora

Sessão

Formato

Dia 1, Segunda-feira, 6 de Novembro de 2023

9:00

Boas-vindas, Introdução, Horário do Curso

Apresentação

9:30

Introdução ao Specify – componentes: Specify 6, 7, catálogo web, gestor de anexos

Apresentação

10:00

Introdução ao Specify – Generalidades e Conceitos Chave

Apresentação

10:30

Interface do programa, formulários e navegação

Apresentação

11:00

Intervalo

11:30

Inserção e edição de dados – Parte 1

Apresentação/Exercícios

12:00

Inserção e edição de dados – Parte 2

Apresentação/Exercícios

12:30

Almoço

14:00

Inserção e uso de dados estruturados em árvore

Apresentação/Exercícios

14:30

Uso avançado na inserção e edição de dados – Parte 1: Dados Geográficos

Apresentação/Exercícios

15:00

Uso avançado na inserção e edição de dados – Parte 1: Dados Taxonómicos

Apresentação/Exercícios

16:00

Intervalo

 

16:30

Obter Dados – Parte 1: Pesquisa simples

Apresentação/Exercícios

17:00

Perguntas e respostas, revisão do dia 1

Discussão

18:00

Final dia 1

 

Dia 2, Terça-feira, 7 de Novembro de 2023

9:00

Revisão do dia 1: Procedimentos e Conceitos Básicos

Apresentação

9:30

Obter Dados – Parte 2: Pesquisa estruturada

 

10:00

Configurações e segurança em Specify

 

10:30

Intervalo

 

11:00

Análise dos formulários de Specify

Exercícios

12:00

Listas e Vocabulários Controlados em Specify

Apresentação/Exercícios

12:30

Almoço

14:00

Criação de uma coleção

Apresentação/Exercícios

14:15

WorkBench -- Parte 1: Importar e editar Dados

Apresentação/Exercícios

14:45

WorkBench -- Parte 2: Mapear Dados entre Workbench e Specify

Apresentação/Exercícios

15:30

Interações (Empréstimos/Ofertas/Pedidos de empréstimo)

Apresentação

16:00

Intervalo

16:30

Impressão de etiquetas e relatórios em Specify

Apresentação

17:00

Exportação de dados, incluindo para o GBIF

Apresentação

17:30

Perguntas e respostas, revisão do dia 2

Discussão

18:00

Final dia 2

 

Dia 3, Quarta-feira, 8 de Novembro de 2023

9:00

Revisão do dia 2: Edição e importação de dados

Apresentação

9:30

Qualidade de Dados na Catalogação de Coleções Biológicas

Apresentação/Discussão

10:00

Georreferenciação de coleções

Apresentação

10:30

Intervalo

11:00

Georreferenciação de coleções com Specify

Apresentação

11:45

Georreferenciação de coleções com Specify – Prática

Exercícios

12:30

Almoço

14:00

Instalação do Specify – sistema e requisitos

Apresentação

14:45

Configuração do Specify – criação de base de dados

Apresentação

15:30

Revisão sobre os projetos globais de informação sobre Biodiversidade

Apresentação

16:00

Intervalo

16:30

Perguntas e respostas, revisão do dia 3

Discussão

17:00

Perspetivas futuras e Encerramento

Discussão

18:00

Final do curso

 

Dia 4, Quinta-feira, 9 de Novembro de 2023

9:00

Padrão de dados Darwin Core: termos, conceitos e exemplos

Apresentação

9:30

Preparação de um conjunto de dados segundo o padrão de dados Darwin Core (prática)

Apresentação/Exercícios

10:30

Intervalo

11:00

Introdução à plataforma IPT: estrutura, metadados, extensões, Publicação, registo

Apresentação

11:45

Preparação de um conjunto de dados para publicação com IPT (prática)

Exercícios

12:30

Almoço

14:00

Preparação de um conjunto de dados para publicação com IPT (prática)

Exercícios

15:00

Perspetivas futuras e Encerramento

Discussão

15:30

Final do curso

 

 

Apresentações

 

Apresentação
Introdução
Estrutura e terminologia em Specify 6
Qualidade e limpeza de dados
Controlo de qualidade de dados geográficos
O panorama da informática para a biodiversidade e o papel do GBIF
Padrão de dados Darwin Core: termos, conceitos e exemplos

 

Exercícios

 

Descarregar fichas de exercícios.

Descarregar dados para exercícios.

Preparação de um conjunto de dados segundo o padrão de dados Darwin Core -

Máquina Virtual

A seguinte máquina virtual, disponível para VirtualBox, contém todo o software e base de dados de demonstração utilizadas no curso: specify-curso.ova. Esta está preparada para ser importada para VirtualBox 7.

Lista de Participantes

ID Nome Organização
1 Carlos Lobo Instituto das Florestas e da Conservação da Natureza
2 Carolina Ornelas Museu de História Natural do Funchal
3 Cláudia Ribeiro Instituto das Florestas e da Conservação da Natureza
4 Dino Gouveia Museu da Baleia
5 Dora Pombo Universidade da Madeira
6 Francisco Silva Universidade da Madeira
7 Hugo Silva Universidade da Madeira
8 João Pedro Ferreira Museu de História Natural do Funchal
9 João Silva Museu de História Natural do Funchal
10 Juan Silva Museu de História Natural do Funchal
11 Luena Marques Universidade de Évora
12 Luís Silva Museu de História Natural do Funchal
13 Manuel Biscoito Museu de História Natural do Funchal
14 Marina Pinto Museu de História Natural do Funchal
15 Martim Melim Museu de História Natural do Funchal
16 Miguel Franquinho Laboratório de Qualidade Agrícola
17 Ricardo Araújo Museu de História Natural do Funchal
18 Sara Ferreira Museu de História Natural do Funchal
19 Ysabel Gonçalves Museu de História Natural do Funchal