Objetivo do curso
Data e local
Descrição
Participantes
Requisitos
Inscrição
Informações
Preparação do curso
Programa
Apresentações
Lista de participantes
Participantes no curso de formação em Angra do Heroísmo. Para descarregar a imagem na resolução original, clique aqui
Participantes no curso de formação em Ponta Delgada. Para descarregar a imagem na resolução original, clique aqui
Objetivo do curso
O principal objetivo do curso é dar formação sobre os padrões de dados, metodologias e ferramentas preparação e publicação de dados de biodiversidade através do GBIF, e sobre a preparação de artigos de dados com base nos metadados dos conjuntos de dados.
Datas e locais
Angra do Heroísmo: 11-12 Junho 2019
Ponta Delgada: 13-14 Junho 2019
Descrição
Este curso é desenvolvido em colaboração com o AZORESBIOPORTAL - PORBIOTA (ACORES-01-0145-FEDER-000072) , com o principal objetivo de dar formação sobre os protocolos de dados, metodologias e ferramentas para a organização, preparação e publicação de dados de biodiversidade através do GBIF. Será também abordada a criação de artigos de dados, com base nos metadados de descrição de conjuntos de dados. O curso, de cariz teórico-prático, é dirigido à equipa do AZORESBIOPORTAL - PORBIOTA, componente regional da infraestrutura de investigação PORBIOTA, e visa capacitar os parceiros da Infraestrutura de Investigação PORBIOTA para a publicação de dados de biodiversidade através do GBIF.
O curso cobrirá os seguintes tópicos:
-
Padrões de dados e organização de dados de biodiversidade
-
Controlo de qualidade e limpeza dos dados
-
Publicação de dados através da plataforma GBIF Integrated Publishing Toolkit (IPT)
-
Preparação e publicação de um artigo de dados
Participantes
O curso é aberto a membros da equipa e colaboradores do projecto AZORESBIOPORTAL – PORBIOTA.
Requisitos
Os participantes da sessão de Angra do Heroísmo devem trazer portátil, com browser para acesso à internet e folha de cálculo. Para os participantes da Ponta Delgada, o portátil é facultativo. Se possível, deve fazer a pré-instalação de OpenRefine (http://openrefine.org). Não é necessário a instalação de qualquer outro software.
Idealmente, os participantes deste curso deverão trazer um conjunto de dados de biodiversidade para realizar as partes práticas de padronização, publicação e preparação de metadados e artigo de dados. No caso de não ter a possibilidade de trazer esse conjunto de dados, será fornecido um, como exemplo.
Inscrição
Apesar de ser reservado a membros da equipa do projecto AZORESBIOPORTAL – PORBIOTA, recomenda-se a inscrição para facilitar comunicações na preparação do curso, e follow-up após o mesmo. Pode efetuar a sua inscrição até 20 de Maio de 2019. Use para o efeito o formulário de inscrição. Solicita-se um pequeno resumo sobre a actividade anterior relacionada com dados de biodiversidade.
A lista de alunos participantes será publicada nesta página no dia 25 de Maio de 2019.
Datas e locais:
11-12 de Junho de 2019, Angra do Heroísmo, Campus Universitário, Edificio Interdepartamental, Faculdade de Ciências Agrárias e do Ambiente (Grupo da Biodiversidade dos Açores - GBA-cE3c)
13-14 de Junho de 2019, Ponta Delgada, Campus Universitário, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Dep. de Biologia.
Organização: Nó Português do GBIF, Instituto Superior de Agronomia e Universidade dos Açores, no âmbito do AZORESBIOPORTAL - PORBIOTA
Formador: Rui Figueira
Língua do curso: Português
Nº máximo de participantes: 20 em cada um dos cursos
Total de horas de formação: 18h
Data limite para candidatura: 20 de Maio de 2019
Preço de inscrição: gratuito
Contacto: node@gbif.pt
Inscrição: através do seguinte formulário
Preparação do curso
Os participantes da sessão de Angra do Heroísmo devem trazer portátil, com browser para acesso à internet e folha de cálculo. Para os participantes da Ponta Delgada, o portátil é facultativo. Se possível, deve fazer a pré-instalação de OpenRefine (http://openrefine.org). Não é necessário a instalação de qualquer outro software.
Os participantes que utilizem um conjunto de dados próprio para ser utilizado nas sessões práticas, devem compilar previamente a informação necessária, de forma a assegurar que têm todos os dados necessária para a criação de um recurso pronto a ser publicado através do GBIF, no final do curso.
1. Tabela de dados
Idealmente, a tabela de dados de ocorrência ou amostragem deve incluir a seguinte informação:
- nome científico da espécie, incluindo o nome do autor da espécie, assim como informação dos níveis taxonómicos superiores: Reino, Filo, Classe, Ordem, Família, Género;
- data de observação/colheita, nome do observador/colector
- local de observação ou colheita, assim como os níveis administrativos superiores: País, Distrito (Província), Município
- coordenada geográfica (se disponível), assim como o método pelo qual foram obtidas (GPS, a partir de uma carta, com Google maps...)
- nome do determinador/identificador da espécie
- no caso de amostragens ou inventários, a frequência/abundância/nº de indivíduos observados, assim como o protocolo de amostragem (e.g. captura com armadilha) e esforço de amostragem (e.g. duração da captura)
- notas sobre o habitat, notas sobre o local, notas sobre a ocorrência (e.g associado a outras espécies)
2. Descrição dos dados
A descrição dos dados (metadados) requer também a compilação da seguinte informação:
- nome da entidade detentora dos dados
- resumo sobre o conjunto de dados (tipo de fonte, cobertura taxonómica, cobertura geográfica e temporal do conjunto de dados)
- descrição sobre a cobertura geográfica, taxonómica, temporal
- se aplicável, informação sobre o projeto no qual se obtiveram os dados, incluindo fontes de financiamento, descrição da área de estudo e metodologia
- descrição sobre a área de estudo, metodologia de amostragem, controlo de qualidade e diferentes passos da realização do trabalho
- referências bibliográficas de recursos utilizados para preparar o conjunto de dados, assim como de recursos que utilizaram os dados.
Normalmente esta informação está disponível nos projectos ou trabalhos realizados sobre o âmbito do conjunto de dados, pelo que a listagem aqui feita, não sendo exautiva, serve para assegurar que esta informação está acessível durante o curso.
(descarregar programa em pdf)
Dia 1
09:00-09:30h - Bloco 0 - Apresentação
0.1. Boas-vindas
0.2. Apresentação dos participantes
09:30-10:30h - Bloco 1 - Introdução geral
1.1. O panorama da informática para a biodiversidade e o papel do GBIF
1.2. Importância da publicação de dados através do GBIF
1.3. Ciência Aberta e Dados Abertos
1.4. Fluxo de publicação de dados através do GBIF
10:30-11:00h - Intervalo
11:00-12:30h - Bloco 2 - Qualidade e limpeza de dados - I
2.1. Conceitos de qualidade de dados e controlo de qualidade
2.1.1. Dados taxonómicos
2.1.2. Dados geográficos
2.1.3. Pessoas e entidades, datas
2.1.4. Dados sensíveis
2.2. Ferramentas e recursos para a limpeza de dados
2.3. OpenRefine: demonstração e exemplos
12:30-14:00h - Intervalo para almoço
14:00-16:00h - Bloco 3 - Qualidade e limpeza de dados - II
3.1. Prática de limpeza de dados com OpenRefine
3.2. Controlo de qualidade de Dados Geográficos
3.3. Prática de controlo de qualidade de Dados Geográficos
16:00-16:30h - Intervalo
16:0-18:00h - Bloco 4 - Padrão de dados Darwin Core
4.1. Padrão de dados Darwin Core: termos, conceitos e exemplos
4.2. Preparação de um conjunto de dados segundo o padrão de dados Darwin Core (prática)
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Dia 2
09:00-10:30h - Bloco 5 - Plataforma Integrated Publishing Toolkit (IPT)
5.1. Introdução à plataforma IPT: estrutura, metadados, extensões, publicação, registo
5.2. Preparação de um conjunto de dados para publicação com IPT (prática)
10:30-11:00h - Intervalo
11:00-12:30h - Bloco 5 - Plataforma Integrated Publishing Toolkit (IPT) (continuação)
5.3. Preparação de um conjunto de dados para publicação com IPT (prática)
12:30-14:00h - Intervalo para almoço
14:00-16:00h - Bloco 6 - Preparação de um artigo de dados
6.1. Vantagens da publicação de artigos de dados e exemplos
6.2. Demonstração da preparação de um artigo de dados utilizando o IPT
16:00-16:30h - Intervalo
16:30-17:30h - Bloco 7 - Preparação de um artigo de dados utilizando o IPT (prática)
7.1. Preparação de um artigo de dados utilizando o IPT (prática)
17:30-18:00h - Bloco 8 - Conclusão e avaliação do curso
8.1. Sumário, discussão, conclusões e avaliação do curso
Apresentações utilizadas durante o curso:
Sessão 00 - cursoPublicacaoGBIF - apresentacao
Sessão 01 - cursoPublicacaoGBIF - introducao
Sessão 02 - cursoPublicacaoGBIF - DarwinCore
Sessão 03 - cursoPublicacaoGBIF - QualidadeDados
Sessão 04 - cursoPublicacaoGBIF - Georreferenciacao
Sessão 05 - cursoPublicacaoGBIF - OpenRefine
Sessão 06 - cursoPublicacaoGBIF - IPT
Sessão 07 - cursoPublicacaoGBIF - DataPapers
ID | Nome Completo | Organização | País |
1 | Alejandra Ros-Prieto | Grupo da Biodiversidade dos Açores | Portugal |
2 | Ana Cristina de Matos Ricardo da Costa | FCT_Universidade dos Açores; CIBIO/InBio | Portugal |
3 | Ana Isabel de Melo Azevedo Neto | GBA/cE3c-Grupo de Biodiversidade dos Açores/Centro de Ecologia, Evolução e Alterações Ambientais | Portugal |
4 | Ana Luísa Coderniz Picanço | GBA/IBBC - cE3c | Portugal |
5 | Andrea Zita Costa Botelho | CIBIO Açores | Portugal |
6 | António Onofre Costa Miranda Soares | Universidade dos Açores | Portugal |
7 | Cândida Sofia Guerreiro Ramos | Universidade dos Açores, pólo de Angra do Heroísmo | Portugal |
8 | Catarina Ritter | CIBIO-Açores | Portugal |
9 | Clara Polaino Martín | University of the Azores | Portugal |
10 | Daniela Gabriel | CIBIO-Açores | Portugal |
11 | Diogo Pavão | CIBIO-Açores | Portugal |
12 | Elisabete Furtado Dias | Universidade dos Açores | Portugal |
13 | Enésima Pereira Mendonça | Grupo da biodiversidade dos Açores | Portugal |
14 | Hugo Renato Marques Garcia Calado | Santa Casa da Misericórdia da Ribeira Grande | Portugal |
15 | Ignacio Moreu Badia | GBA/cE3c-Grupo de Biodiversidade dos Açores/Centro de Ecologia, Evolução e Alterações Ambientais | Portugal |
16 | Isabel Borges | University of the Azores | Portugal |
17 | Isabel Maria Amorim do Rosário | GBA | Portugal |
18 | João Pedro da Silva Ramos Barreiros | Universidade dos Açores | Portugal |
19 | José Manuel Viegas Oliveira Neto Azevedo | GBA/cE3c-Grupo de Biodiversidade dos Açores/Centro de Ecologia, Evolução e Alterações Ambientais | Portugal |
20 | Lara Sofia Pereira Dutra da Silva | CIBIO/InBIO Universidade dos Açores | Portugal |
21 | Lucas Lamelas López | Grupo da Biodiversidade dos Açores | Portugal |
22 | Lurdes Da Conceição Borges Silva | CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Universidade dos Açores | Portugal |
23 | Manuela Isabel Paente Cardoso | CIBIO/InBio, Universidade dos Açores | Portugal |
24 | Maria Teresa Monteiro da Rocha Bravo Ferreira | Grupo da Biodiversidade dos Açores | Portugal |
25 | Paulo Alexandre Vieira Borges | Grupo da Biodiversidade dos Açores | Portugal |
26 | Rosalina Gabriel | University of the Azores | Portugal |
27 | Rui Miguel dos Santos Carvalho | cE3c - Grupo da Biodiversidade dos açores | Portugal |
28 | Rui Miguel Pires Bento da Silva Elias | CE3C/ABG, Universidade dos Açores, Faculdade de Ciências Agrárias e do Ambiente | Portugal |
29 | Sérgio Ávila | CIBIO-Açores | Portugal |
30 | Sophie Wallon | Grupo da Biodiversidade dos Açores (Terceira) | Portugal |
31 | Vítor Manuel da Costa Gonçalves | CIBIO-Açores | Portugal |